Один голубой глаз и один желтовато‑зеленый чаще всего встречаются на белой морде, потому что гены, «стирающие» окраску шерсти, одновременно вмешиваются в образование пигмента в глазах. Знакомый многим желтовато‑зеленый взгляд большинства кошек формируется по другому, более устойчивому пути, основанному на накоплении меланина в радужке.

У кошек с глазами разного цвета обычно есть доминантный ген белой окраски или выраженный ген белой пятнистости. Оба варианта начинают действовать очень рано, еще в период эмбрионального развития, когда предшественники меланоцитов мигрируют по коже и в сосудистую оболочку глаза. Если на одной стороне этот путь прерывается, радужка остается без меланина, и глаз выглядит голубым. Если миграция завершается, формируется привычный желтовато‑зеленый глаз. Такая мозаичная распределенность меланоцитов лежит в основе секторальной гетерохромии у многих видов, но у кошек она особенно тесно связана именно с генами окраса шерсти.

У обычных кошек желтовато‑зеленые глаза появляются, когда синтез меланина в строме радужки идет нормально и почти не зависит от генов, отвечающих за экстремально белый окрас. Здесь активность тирозиназы и дальнейшее образование меланина происходят симметрично в обоих глазах, поэтому их цвет совпадает и чаще соотносится с общим окрасом шерсти, а не с белой пятнистостью. В результате у беспородных кошек чаще всего встречается «спокойная» пара однотонных желтовато‑зеленых глаз, тогда как поразительный двухцветный взгляд появляется главным образом там, где миграция пигмента частично блокирована аллелями, усиливающими белый цвет.